Laboratorium Spektrometrii Mas (LW-07)
Wydział Chemii UWr.
Mass++
Mass++ to otwartoźródłowy program do wizualizacji i analizy danych ze spektrometrów mas różnych producentów. Dane (widmo MS lub chromatogram LC-MS należy w oryginalnym oprogramowaniu przekonwertować do formatu mzXML).
MarvinSketch
Zaawansowany edytor wzorów chemicznych. Posiada liczne moduły obliczające m.in. energie konformerów. Doskonale radzi sobie z nazewnictwem nawet bardzo złożonych związków.
WSearch
Prosty, ale użyteczny i godny polecenia program pozwalający na przeglądanie i analizę widm MS zapisanych w różnych formatach (czyta m.in. pliki mzXML uzyskane w wyniku konwersji plików .baf programem CompassXport). Ma parę użytecznych funkcji - np. generowanie profilu izotopowego na podstawie wzoru sumarycznego lub dla podanej sekwencji peptydowej (!).
CompassXport
Program firmy Bruker konwertujący pliki .baf do formatu .mzXML, co pozwala na ich analizę przy użyciu darmowego oprogramowania dostępnego w Internecie (w tym także na stronach LW-7).
Program działa z linii poleceń i pozwala na konwersję wielu plików jednocześnie, ale niestety jest mało przyjazny w obsłudze.
mMass
Program pozwala na przeglądanie i analizę widm masowych zapisanych w różnych formatach (czyta m.in. pliki mzXML uzyskiwane w wyniku konwersji plików .baf programem CompassXport). Ma kilka b. pożytecznych funkcji (m.in. korzystanie z zewnętrznych baz danych sekwencji białkowych, przewidywania fragmentacji peptydów, itp.).
https://github.com/xxao/mMass-Dist/blob/main/v5.5.0/mmass_v5.5.0_msw.zip
ChemSketch Freeware
ChemSketch to bezpłatna (do zastosowań nie komercyjnych) alternatywa dla pakietu ChemOffice. Umożliwia między innymi tworzenie dwu i trójwymiarowych wzorów, wyposażony jest również w bardzo bogate bazy wzorów oraz grup funkcyjnych. Za pomocą programu ChemSketch można przygotować również atrakcyjnie wyglądające animowane modele 3D wzorów strukturalnych. Program akceptuje pliki z ChemOffice (ChemDraw). Liczy m.in. masy cząsteczkowe zwiąkzów oraz ich fragmentów ("nożyczki MS").
Możliwości programu są jednak znacznie szersze także dzięki szeregu dodatkowych modułów jakie można do niego bezpłatnie doinstalować. Program na pewno przyda się chemikom i studentom kierunków chemicznych.
Szanowni Państwo,
miło nam poinformować, że szeregi użytkowników spektrometru masowego qTOF LCMS-9030 zasiliło kolejne pięć osób.
Łącznie w tym roku przybyło aż 26 nowych użytkowników, którzy własnoręcznie mogą wykonywać pomiary rozwijając swoje umiejętności i wiedzę z zakresu spektrometrii mas.
Cieszymy się z tak dużego zainteresowania spektrometrem masowym wyposażonym w źródło jonów typu ESI.
Życzymy owocnych analiz!
Ladies and gentlemen,
We are pleased to announce that five more people joined the ranks of the qTOF LCMS-9030 mass spectrometer users.
In total, this year there were as many as 26 new users who can make measurements by themselves, developing their skills and knowledge in the field of mass spectrometry.
We are pleased with such a great interest in a mass spectrometer equipped with an ESI source.
We wish you fruitful analyzes!
