mzmine

  • Drukuj

mzmine to oprogramowanie typu open source do przetwarzania i wizualizacji danych spektrometrii mas (MS) obsługujący wiele formatów danych w tym formaty otwarte, takie jak mzML, oraz kilka typów plików specyficznych dla danego dostawcy (w tym Bruker .tsf i .baf). Obsługiwane są dane z różnych konfiguracji sprzętowych, takich jak LC-MS, LC-IMS-MS, GC-MS, a nawet MALDI-(IMS-)-MS. Interaktywne narzędzia wizualizacyjne umożliwiają płynne przeglądanie zarówno danych surowych, jak i przetworzonych wyników. Zachęcamy do pobrania i korzystania:
https://mzmine.github.io/mzmine_documentation/getting_started.html 

__________

mzmine is an open-source and platform-independent software for mass spectrometry (MS) data processing and visualization that supports multiple raw data formats, including open formats such as mzML and several vendor-specific file types (e.g. Bruker .baf and .tsf files). Data from various instrumental setups, such as LC-MS, LC-IMS-MS, GC-MS, and even MALDI-(IMS-)-MS is supported:
https://mzmine.github.io/mzmine_documentation/getting_started.html 

Mass++

  • Drukuj

Mass++ to otwartoźródłowy program do wizualizacji i analizy danych ze spektrometrów mas różnych producentów. Dane (widmo MS lub chromatogram LC-MS należy wcześniej przekonwertować do formatu mzXML np. przy pomocu programu ProteoWizard (MSConvert).

Pobierz

 

MarvinSketch

  • Drukuj

Zaawansowany edytor wzorów chemicznych. Posiada liczne moduły obliczające m.in. energie konformerów. Doskonale radzi sobie z nazewnictwem nawet bardzo złożonych związków. Program wymaga licencji, którą można uzyskać wypełniając wniosek na stronie.

Pobierz

 

ProteoWizard

  • Drukuj

Program ProteoWizard zawiera m.in. moduł MSConvert, który konwertuje pliki .baf do formatu .mzXML, co pozwala na ich analizę przy użyciu darmowego oprogramowania dostępnego w Internecie (w tym także na stronach LW-7). Z kolei moduł SeeMS pozwala oglądać widma zapisane w różnych formatach bez konieczności ich konwertowania.

Pobierz

 

mMass

  • Drukuj

Program pozwala na przeglądanie i analizę widm masowych zapisanych w różnych formatach (czyta m.in. pliki mzXML uzyskiwane w wyniku konwersji plików .baf programem CompassXport). Ma kilka b. pożytecznych funkcji (m.in. korzystanie z zewnętrznych baz danych sekwencji białkowych, przewidywania fragmentacji peptydów, itp.).

https://github.com/xxao/mMass-Dist/blob/main/v5.5.0/mmass_v5.5.0_msw.zip 

 

ChemSketch Freeware

  • Drukuj

ChemSketch to bezpłatna (do zastosowań nie komercyjnych) alternatywa dla pakietu ChemOffice. Umożliwia między innymi tworzenie dwu i trójwymiarowych wzorów, wyposażony jest również w bardzo bogate bazy wzorów oraz grup funkcyjnych. Za pomocą programu ChemSketch można przygotować również atrakcyjnie wyglądające animowane modele 3D wzorów strukturalnych. Program akceptuje pliki z ChemOffice (ChemDraw). Liczy m.in. masy cząsteczkowe zwiąkzów oraz ich fragmentów ("nożyczki MS").

Możliwości programu są jednak znacznie szersze także dzięki szeregu dodatkowych modułów jakie można do niego bezpłatnie doinstalować. Program na pewno przyda się chemikom  i  studentom kierunków chemicznych.

Pobierz

 

ShoppingASEhandelASErhvervIndexDKServiceIndexDK