W dziale "Do pobrania" zamieszczone zostało oprogramowanie pozwalające na konwersję plików .baf ze spektrometrów MS firmy Bruker do otwartego formatu mzXML. Przetworzone widma można następnie przeglądać przy pomocy programów, które również można pobrać korzystając z linków na naszej stronie (mMass, WSearch i in.).

Pliki mzXML można analizować za pomocą darmowego i dostępnego oprogramowania Mass++.

Oryginalne pliki .baf można analizować przy pomocy programu Bruker DataAnalysis zainstalowanego m.in. w czytelni czasopism Biblioteki Wydziałowej WChUWr.