Laboratorium Spektrometrii Mas (LW-07)
Wydział Chemii UWr.
Jak mogę samodzielnie obrabiać pliki ze spektrometru MS?
Oryginalne pliki .baf (za spektrometrów firmy Bruker) można analizować przy pomocy programu Bruker DataAnalysis (wersja > 4) zainstalowanego m.in. w czytelni czasopism Biblioteki Wydziałowej WChUWr. Pliki można także przy pomocy firmowego oprogramowania zapisać np. w formacie mzXML, który jest odczytywany przez wiele darmowych programów.
W dziale "Do pobrania" zamieszczone zostało oprogramowanie pozwalające na konwersję plików .baf ze spektrometrów Bruker do otwartego formatu mzXML. Przetworzone widma można następnie przeglądać przy pomocy programów, które również można pobrać korzystając z linków na naszej stronie (mMass, WSearch i in.).
Pliki ze spektrometrów firmy Shimadzu można przy pomocy firmowego oprogramowania zapisać w formacie mzXML. Pliki takie można następnie analizować za pomocą darmowego i dostępnego oprogramowania Mass++ lub mMass.
W ramach jednolitego systemu przechowywania/udostępniania elektronicznych wyników pomiarów z laboratoriów wydziałowych istnieje możliwość pobierania danych pomiarowych z Laboratorium Spektrometrii Mas. Dostęp do plików możliwy jest głównie poprzez protokół ftp (w tym bezpieczny wariant wykorzystujący szyfrowane połączenie z wykorzystaniem mechanizmu TSL/SSL: połączenia typu ftps lub ftpes):
- serwer: labs.chem.uni.wroc.pl
- użytkownik: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
- hasło: identyczne jak do poczty wydziałowej
Dane pomiarowe można także pobierać korzystając z serwera FTP. Jest to zalecany i preferowany sposób odbioru widm, zwłaszcza jeśli ktoś często zleca wykonanie większej ilości pomiarów. Aktualne adresy IP, wraz z numerami portów, służące do połączeń FTP:
- Shimadzu IT-TOF: 192.168.0.140:50008
- Shimadzu qTOF: 192.168.0.141:50013
Warunkiem skorzystania z tej możliwości jest posiadanie konta na serwerze (osobne konto dla każdego z aparatów). Osoby zainteresowane prosimy o kontakt z dr Markiem Cebratem (tel. 7-151, pok. 253B).
