Laboratorium Spektrometrii Mas (LW-07)
Wydział Chemii UWr.
mzmine - program do wizualizacji i obróbki widm MS
Szanowni Państwo,
mzmine to oprogramowanie typu open source do przetwarzania i wizualizacji danych spektrometrii mas (MS) obsługujący wiele formatów danych w tym formaty otwarte, takie jak mzML, oraz kilka typów plików specyficznych dla danego dostawcy (w tym Bruker .tsf i .baf). Obsługiwane są dane z różnych konfiguracji sprzętowych, takich jak LC-MS, LC-IMS-MS, GC-MS, a nawet MALDI-(IMS-)-MS. Interaktywne narzędzia wizualizacyjne umożliwiają płynne przeglądanie zarówno danych surowych, jak i przetworzonych wyników. Zachęcamy do pobrania i korzystania:
https://mzmine.github.io/mzmine_documentation/getting_started.html
__________
Dear users,
mzmine is an open-source and platform-independent software for mass spectrometry (MS) data processing and visualization that supports multiple raw data formats, including open formats such as mzML and several vendor-specific file types (e.g. Bruker .baf and .tsf files). Data from various instrumental setups, such as LC-MS, LC-IMS-MS, GC-MS, and even MALDI-(IMS-)-MS is supported:
https://mzmine.github.io/mzmine_documentation/getting_started.html
W ramach jednolitego systemu przechowywania/udostępniania elektronicznych wyników pomiarów z laboratoriów wydziałowych istnieje możliwość pobierania danych pomiarowych z Laboratorium Spektrometrii Mas. Dostęp do plików możliwy jest głównie poprzez protokół ftp (w tym bezpieczny wariant wykorzystujący szyfrowane połączenie z wykorzystaniem mechanizmu TSL/SSL: połączenia typu ftps lub ftpes):
- serwer: labs.chem.uni.wroc.pl
- użytkownik: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
- hasło: identyczne jak do poczty wydziałowej
Dane pomiarowe można także pobierać korzystając z serwera FTP. Jest to zalecany i preferowany sposób odbioru widm, zwłaszcza jeśli ktoś często zleca wykonanie większej ilości pomiarów. Aktualne adresy IP, wraz z numerami portów, służące do połączeń FTP:
- Shimadzu IT-TOF: 192.168.0.140:50008
- Shimadzu qTOF: 192.168.0.141:50013
Warunkiem skorzystania z tej możliwości jest posiadanie konta na serwerze (osobne konto dla każdego z aparatów). Osoby zainteresowane prosimy o kontakt z dr Markiem Cebratem (tel. 7-151, pok. 253B).
